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Intérêts de recherche

Reconstruction de Génomes ancestraux et Génomique Comparée

  • Algorithmes de reconstruction des scénarios évolutifs
  • Prédiction de séquences fonctionnelles
  • Visualisation des génomes ancestraux
  • Étude évolutive des familles d'organismes
  • Optimisation d'algorithmes pour l'applicabilité à des génomes complets
  • Détection de transfert horizontal de gènes

Correction d'alignement et inférence phylogénétique

  • Détection et amélioration des résultats de méthode d'alignement
  • Raffinage d'arbres phylogénétiques
  • Construction conjointe de phylogénie et d'alignement
  • Construction d'alignement statistique

Analyse de Données biologiques et biomédicales

  • Étude évolutive des phages
  • Étude du carcinome des virus du papillome humain
  • Étude des protéobactéries

Développement d'applications bioinformatiques

  • Gestion de données cliniques
  • Gestion de procédures d'analyse laboratoire
  • Mise en place de ressources bioinformatiques à large échelle
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